在企业支付工资时，通常税务规定要求所有工资应通过银行转账进行支付。这是为了确保工资支付的透明性、合规性，并便于税务机关的监督。如果公司选择将部分工资通过银行转账支付，部分通过现金发放，虽然这种做法在一些企业中仍然存在，但它可能带来一定的税务风险。
一、税务合规要求
根据中国现行的税法规定，企业在支付员工工资时，必须依法代扣代缴个人所得税，且所有的工资支付都应该通过银行转账进行。这一要求是为了确保个税的征收能够准确进行，并避免出现逃税、漏税的现象。税务机关通过银行转账的方式可以较容易地跟踪和审查工资支付情况，从而保证税收的准确和及时收取。
因此，如果公司选择通过现金支付工资，尤其是未依法申报个税，可能会引发税务风险。如果税务机关进行稽查并发现这一情况，企业可能需要补缴未缴纳的个人所得税，并支付相应的滞纳金和罚款。
二、税务风险分析
- 补缴税款：如果税务机关发现公司未按规定代扣代缴个税，企业将面临补缴税款的风险。虽然一般情况下，税务机关可能不会主动检查小范围的现金发放，但如果被查到，公司必须按照规定补交相应的个税，并承担滞纳金。
- 滞纳金与罚款：除了补缴税款外，根据《税收征收管理法》规定，如果企业未按时申报并缴纳个人所得税，还可能需要支付滞纳金。滞纳金是按未缴税款的金额以及逾期的时间计算的。此外，税务机关还可以对企业处以罚款，罚款的金额通常根据企业未按规定缴纳税款的金额和情节严重程度而定。
- 责任承担：根据税法规定，企业有责任为员工代扣代缴个人所得税，因此如果发生税务问题，责任一般由公司承担，而非员工个人。即使员工已经收到工资，如果公司未代扣代缴税款，后果将由公司承担，包括滞纳金和罚款。
三、如何减少风险？
为了避免可能的税务风险，员工应尽量确保工资通过银行转账支付，这样可以避免现金支付可能带来的不确定性。同时，公司应当按时、足额代扣代缴个人所得税，避免税务机关的稽查风险。如果已经发生现金发放的情况，建议尽量通过正规渠道进行补救，确保所有的税务记录清晰、透明。
总之，尽管在一些小型企业中现金发放工资仍然存在，但从长远来看，建议遵循税务法规，确保所有工资支付都通过银行转账进行，并及时缴纳个人所得税。这样既可以减少税务风险，也有助于企业和员工的税务合规。