在企业经营中，预付供应商款项后，对方仅部分开票导致“应付账款”出现贷方负数余额（即实质上变成了预付或多付款项），是一个典型的业务与票据不同步的财税问题。正确处理此问题，关键在于清晰区分会计账务处理与税务税前扣除这两套不同规则，并基于业务实质进行规范操作，而非简单地“直接调成本”。
一、 现象本质：应付账款负数的财务实质
“应付账款”科目核算企业因购买材料、商品或接受劳务等经营活动应支付的款项。正常情况下，其余额应在贷方，表示欠付供应商的债务。当该科目出现贷方负数（在财务报表上常重分类至“预付账款”资产项目列示）时，其经济实质是：企业已支付的款项，超过了根据已收到发票或已确认债务的金额。 这通常意味着：
- 预付了货款，但货物或服务尚未交付完毕，发票也未全额开具。
- 支付款项后，供应商因各种原因延迟或拒绝就全部款项开票。
二、 会计处理：遵循权责发生制，据实反映成本
会计处理的核心原则是权责发生制和真实性。只要相关成本费用对应的经济活动（如接收货物、接受服务）已经真实发生，且与企业经营相关，无论是否取得发票，都应在会计上确认相应的成本或费用以及负债（或减少预付账款）。
- 错误做法：因为缺少发票而将实际已发生的成本悬置于往来账，或武断地“直接调成本”。这会导致成本确认期间不准确，财务报表失真。
- 正确操作步骤：
- 核实业务实质：与业务部门核实，已付款项对应的货物是否已入库、服务是否已提供完毕。获取入库单、服务验收单等内部凭证。
- 进行暂估入账：在会计期末（如月末、季末），对于已实际发生但未取得发票的成本费用，应基于合同协议、入库单等资料进行暂估入账。
- 会计分录示例：借记“原材料”、“库存商品”、“管理费用”等成本费用科目，贷记“预付账款”或“应付账款——暂估”科目。此举将“应付账款”的负数余额（即预付账款实质）结平，同时确认资产或成本。
- 后续收到发票时：待取得合规发票后，冲销之前的暂估分录，按发票金额做正式入账。若存在小额差异，调整相应成本费用科目。
三、 税务处理：凭合规票据扣除，无票支出不得扣除
企业所得税的税前扣除，遵循“真实性、相关性、合理性”原则，但必须以合规的税前扣除凭证作为支撑。根据国家税务总局公告2018年第28号文规定，企业在境内发生的支出，发票是主要的税前扣除凭证。
- 核心规则：对于未取得发票的这部分支出，在企业所得税汇算清缴时，不得税前扣除，需进行纳税调增，增加当期应纳税所得额。
- 重要例外与后续处理：如果企业在汇算清缴期结束前（次年5月31日前）能够补开、换开发票，相应支出仍可在所属年度扣除。若因对方注销、撤销等特殊原因无法补票，在提供合同、付款凭证、货物入库证明等资料证实支出真实性后，其支出允许税前扣除。
- “调成本”的税务误区：用户提到的“直接调成本”，在税务层面是无效的。税务稽查时，判断成本能否扣除的关键依据是凭证（发票等），而非账上记载在哪个科目。仅做账务调整无法改变无票支出不得税前扣除的税务结果。
四、 综合应对策略与风险提示
- 加强前端合同与流程管理：在采购合同中明确约定付款进度与发票开具的严格挂钩条件。实行“先票后款”或“见票付款”，从源头控制风险。
- 积极沟通与催收票据：财务部门应定期清理应付账款负数余额，主动联系供应商催要发票。对于长期挂账的预付或负应付余额，需评估供应商持续经营能力及坏账风险。
- 规范内部单据与账务：即使暂无发票，也必须依据内部合规单据（如入库单、费用报销单）进行暂估入账，确保账实相符。同时，在汇算清缴时，务必对无票支出金额进行准确的纳税调增。
- 评估法律手段：对于恶意不开票的供应商，应依据合同条款追究其违约责任，必要时可考虑法律途径解决，以维护企业获取合法票据的权益。
总结：面对付款后对方不开票导致的应付账款负数问题，会计上应基于业务实质进行暂估入账，准确反映成本与资产；税务上则必须认识到，无合规发票对应部分的支出不得在当期税前扣除。企业应通过强化合同管理、主动催票和规范账务处理来系统性地解决和预防此类问题，而非进行简单却无效的账目调整。