在劳务派遣行业，增值税处理方式一直是企业关注的焦点。尤其是小规模纳税人，在收取费用时究竟应按全额开具发票，还是可以按差额征税方式开票，实务中容易产生混淆。加之近年来税收政策频繁调整，部分财务人员误以为差额征税已被取消。以下结合现行有效政策，详细解析小规模劳务派遣公司代收代付社保费模式下的开票规则、计税原理及申报要点。
一、政策溯源：差额征税从未取消，适用范围明确
首先需要澄清一个误区：劳务派遣服务的差额征税政策并未取消。根据《财政部 国家税务总局关于进一步明确全面推开营改增试点有关劳务派遣服务、收费公路通行费抵扣等政策的通知》（财税〔2016〕47号）规定，一般纳税人和小规模纳税人提供劳务派遣服务，均可以选择差额纳税，以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额，按照简易计税方法依5%的征收率计算缴纳增值税。
该政策在后续历次税收规范性文件中均未被废止或修改。2023年出台的小规模纳税人减免增值税公告（如财政部 税务总局公告2023年第1号、2023年第19号）主要调整的是免征额标准及征收率，并未涉及劳务派遣差额征税政策的取消。因此，截至2026年，小规模劳务派遣公司依然有权选择差额征税方式。
二、收费构成决定开票模式：全额与差额的本质区别
劳务派遣公司向用工单位收取的费用通常包含两部分：一是代收代付的社保费、住房公积金、工资等（以下简称“代收款项”）；二是公司自身赚取的管理服务费（以下简称“服务费”）。这两部分在增值税处理上存在本质差异。
- 若选择全额开票
公司将全部收费（含代收社保及服务费）作为销售额，按适用征收率（如5%或1%）开具发票。此时，代收社保部分被视为公司收入的一部分，需缴纳增值税。但考虑到这部分资金最终需支付给社保部门，全额纳税会导致公司税负较重。 - 若选择差额开票
公司仅就服务费部分缴纳增值税，代收社保部分在计算销售额时予以扣除。开票时，系统支持两种方式： - 方式一：通过新系统中差额征税开票功能，录入全部价款和扣除额，系统自动计算税额并打印发票。票面显示“差额征税”字样，税额按差额计算。
- 方式二：分别开票，即对服务费部分按正常税率开票，对代收社保部分开具普通发票（或不征税发票），但这种方式操作繁琐且易引发争议，实务中多采用第一种差额开票功能。
三、小规模纳税人的特殊选择权与税负测算
假设某小规模劳务派遣公司于2025年8月与客户签订合同，约定每月收取费用63万元，其中代缴社保费58万元，管理服务费5万元。公司可选择以下两种计税方式：
- 方案A：全额纳税
销售额63万元，按3%征收率（假设2025年小规模纳税人适用3%减按1%政策已结束，恢复3%）计算：
应纳税额 = 63 ÷ (1+3%) × 3% = 18,350元
税负率 ≈ 2.91% - 方案B：差额纳税
销售额 = (63 - 58) ÷ (1+5%) × 5% = 5 ÷ 1.05 × 0.05 = 2,381元
税负率 ≈ 0.38%
显然，差额纳税大幅降低了企业税负，尤其是当代收代付金额占比较高时，优势更为明显。
四、开票操作细节与客户沟通要点
选择差额征税后，开票环节需注意以下事项：
- 发票开具
在电子税务局或开票软件中，选择“差额征税”功能，录入总收费金额63万元及扣除额58万元，系统自动计算税额2,381元，价税合计63万元。发票备注栏自动打印“差额征税”字样，购买方可按全额抵扣或入账。 - 向客户解释
部分客户收到差额发票后，可能对发票金额与税额的对应关系产生疑问。公司财务人员应主动说明：发票总额63万元包含代付社保，但税额仅按服务费计算，这是国家给予劳务派遣行业的税收优惠，不影响客户入账及税前扣除。 - 凭证留存
采用差额征税，必须保留证明扣除额真实性的凭证，包括：社保费缴纳凭证（银行回单、社保局缴费单据）、工资发放记录、派遣合同等，以备税务机关核查。
五、差额征税的申报流程
小规模纳税人在办理增值税纳税申报时，差额征税需填写《增值税纳税申报表（小规模纳税人适用）》附列资料。具体填报逻辑如下：
- 将收取的全部价款（63万元）填入“本期发生额”；
- 将允许扣除的社保费（58万元）填入“本期扣除额”；
- 系统自动计算出差额后的销售额（4.76万元）填入主表“应征增值税不含税销售额”栏次。
六、常见误区辨析
误区一：“小规模季度30万免税，选择差额是否多此一举？”
若公司总收费扣除社保后余额未超过免税额度（假设2025年免税标准仍为月10万/季30万），且选择差额纳税，则服务费部分可能免税。但需注意：免税政策与差额征税可叠加享受，但一旦选择差额，计算免税销售额的基数应是差额后的余额。
误区二：“差额开票后，客户无法抵扣进项。”
正确。差额征税发票上注明的税额仅基于服务费计算，客户取得后，只能按该税额抵扣，不能将代付社保部分视为进项。这是劳务派遣行业的特殊规定，客户应知晓。
综上，小规模劳务派遣公司完全有权继续选择差额征税，且该政策稳定有效。企业应根据自身业务规模、客户类型及税负预期，在年度首次申报前作出计税方式选择，并保持一贯性，确保税务处理合规高效。