该通知属于税务机关针对已经享受企业所得税税收优惠的企业进行的常规性事后管理，不是专门针对你公司的风险预警，但也无需掉以轻心。近年来，税务机关对研发费用加计扣除、小型微利企业优惠等项目的核查力度明显增强，尤其是当企业享受优惠后利润恰好“跨越”小微企业门槛时，更容易触发核查。下面从通知性质、自查要点、备查资料清单、应对策略及年度选择原因五个方面详细说明。
一、通知性质：普遍提示，并非个别稽查
根据国家税务总局公告2018年第23号，企业享受企业所得税优惠事项采取“自行判别、申报享受、相关资料留存备查”的方式。也就是说，企业在汇算清缴时可直接申报优惠，无须税务机关事先审批，但必须将证明符合优惠条件的资料整理归档，以备税务机关后续随机抽查或专项核查。你收到的通知正是税务机关在汇算清缴结束后，对享受优惠的企业发出的辅助自查提示，目的是提醒企业检查自身是否符合条件、资料是否完整。如果自查发现问题（例如不符合研发加计扣除范围、多计金额等），应在2026年5月20日前主动更正申报。这属于常态化管理，并非因为你的企业存在明显问题。但如果你公司无法提供有效资料，则可能面临补税、滞纳金乃至罚款。
二、重点自查内容及备查资料清单
根据《企业所得税优惠事项管理目录》，你公司享受的“研发费用加计扣除”优惠（编号R&D-1）需要留存以下资料：
- 自主、委托、合作研究开发项目计划书和企业有权部门关于自主、委托、合作研究开发项目立项的决议文件；
- 自主、委托、合作研究开发专门机构或项目组的编制情况和研发人员名单；
- 经科技行政主管部门登记的委托、合作研究开发项目的合同（仅委托/合作开发需要）；
- 从事研发活动的人员（包括外聘人员）和用于研发活动的仪器、设备、无形资产的费用分配说明（包括工作使用情况记录）；
- 集中开发项目研发费决算表、费用分摊明细表及实际分享收益比例等资料（仅集中开发需要）；
- “研发支出”辅助账及汇总表（2015版或2021版）；
- 企业如果已取得地市级（含）以上科技行政主管部门出具的鉴定意见，也应留存备查；
- 其他相关辅助资料：如研发成果证明、测试报告、新产品证书等。
此外，由于你公司享受研发加计扣除后利润降至210万元，还涉及小型微利企业优惠（编号A2）。该项优惠需要留存：
- 所从事行业不属于限制和禁止行业的说明；
- 从业人数和资产总额的计算过程及证明材料（如工资表、社保缴纳记录、资产负债表等）。
特别注意：所有留存备查资料应当从享受优惠年度的汇算清缴期结束（次年5月31日）起保存10年。如果你公司2025年度的上述资料不完整或缺失，应尽快补充。
三、为何只提示2025年度？——可能触发“临界点”关注
你追问“每年都有享受优惠，为什么只提示2024（替换后为2025）年？” 原因可能有：
- 优惠享受后的利润恰好低于300万元：2025年企业原利润380万元，享受加计扣除320万元后降至210万元，从而符合小型微利企业条件（300万元以下）。税务机关的系统会自动筛选出这类“通过享受优惠使利润跨档”的企业，因为存在人为调节利润的风险（例如将不属于研发范围的支出计入加计扣除）。2023、2024年度虽然也享受了优惠，但可能优惠后的利润仍然超过300万元（未跨档），或者低于300万但未出现明显跳跃，因此未触发重点提醒。
- 研发加计扣除比例提高或政策变动：2025年度研发费用加计扣除比例为100%（制造业、科技型中小企业）或75%（其他企业）。你公司原利润380万元，加计扣除320万元后降为210万元，说明研发费用基数至少320万元（按100%扣除），占原利润比例高达84%，这种“靠研发费用拉低利润”的情形会被系统标记。
- 税务专项核查计划的年度安排：税务机关可能每年设定不同的核查重点。2026年恰好针对2025年度的优惠享受情况进行抽查，与往年度无关。
四、近期税务工作人员可能会联系你：应对策略
- 提前整理资料：将上述备查资料按顺序装订成册，制作目录，确保每一项都有对应佐证。如果部分资料缺失（如某个月的研发辅助账未填写），应立即补做，并确保逻辑合理（不要事后编造日期）。
- 主动自查问题：逐项核对研发费用归集范围是否符合财税〔2015〕119号及国家税务总局公告2017年第40号的规定。常见错误包括：将非研发人员的工资计入、将生产与研发共用的设备折旧未合理分摊、将常规性升级费用计入等。如有问题，应在5月20日前主动更正申报，补缴少量税款可避免罚款。
- 接到联系时积极配合：如果税务人员要求提供资料，一般会给予7-15天时间。按要求报送电子或纸质资料，保持沟通畅通。若资料真实完整，通常不会再深入检查。
五、其他风险提示
- 千万不要伪造资料：如果无法提供某项必要资料（如立项决议），不要事后补签假日期。一旦被认定为虚假申报，可能按偷税处理，后果严重。
- 如果自查发现不应享受优惠（例如研发活动不具创新性），应主动更正申报，补缴企业所得税及滞纳金。滞纳金为每日万分之五（替换为万分之三），金额一般不大。
- 后续年度建议：从2026年起，建立研发费用全流程台账，每季度与技术人员核对，确保年底资料齐全。
六、总结
- 该通知是税务机关对享受优惠企业的普遍性自查提醒，并非专门针对你公司的问题。
- 重点自查“研发费用加计扣除”和“小型微利企业”两项优惠，备齐立项文件、辅助账、人员分配说明、资产计算表等资料。
- 2025年度被抽查可能是因为加计扣除将利润从380万拉至210万，触发了“跨档”预警。
- 积极配合，主动纠错，即可顺利通过。