一、核心结论：收购不改变双方独立的纳税人身份
小规模纳税人企业收购一般纳税人企业，在法律和税务上均为完全可行的操作。收购完成后，母公司与子公司继续保持独立的法人资格，分别作为独立的增值税纳税人，各自计算、申报并缴纳各自的税款。母公司是否能够继续作为小规模纳税人计税，取决于母公司自身的年应税销售额是否超过小规模纳税人标准，与被收购子公司的纳税人身份无关。
因此，原始回答中“各交各的税”在原则层面是正确的——母子公司各自独立纳税，不受对方身份影响。但需要补充说明的是：收购行为本身不会直接导致任何一方丧失或取得特定纳税人资格，但收购后如果母子公司之间发生关联交易，则必须按照独立交易原则确定价格，并依法履行各自的纳税义务。
二、一般纳税人资格的存续条件
被收购的一般纳税人子公司在收购完成后，其一般纳税人资格不会自动失效，前提是其持续满足一般纳税人的登记条件（即年应征增值税销售额超过500万元，或会计核算健全、能够提供准确税务资料并已主动申请登记）。只要子公司继续保持一般纳税人身份，其增值税处理方式不发生任何改变——销售货物适用13%税率、购进货物取得的专票继续正常抵扣进项税额。
但如果子公司在收购后被注销法人资格、改为母公司的分支机构（非独立法人），则需重新评估纳税主体身份。在此情况下，若分支机构并入母公司统一核算且母公司为小规模纳税人，则该分支机构的经营收入将并入母公司的销售额，可能导致母公司年销售额超标而被迫转为一般纳税人。因此，若希望保留子公司的一般纳税人资格以便继续抵扣进项，应维持其独立法人地位不变。
三、母公司能否继续保留小规模纳税人身份？
母公司的小规模纳税人身份能否保留，不因“控股一家一般纳税人子公司”而改变，仅取决于母公司自身的年应征增值税销售额是否超过小规模纳税人的标准（现行标准为年应征增值税销售额500万元及以下）。如果母公司自身的年销售额仍在该标准以下，且会计核算不健全，则其可以继续作为小规模纳税人，适用简易计税方法（征收率3%，部分情形下可享受减按1%征收的阶段性政策）。
但需注意：母公司持有子公司股权所取得的投资收益（如股息、红利）不属于增值税应税范围，不计入上述销售额的统计口径。母公司向子公司提供货物、劳务或服务所收取的对价，则属于增值税应税销售额，需纳入年销售额的计算。
四、母子公司关联交易的税务处理
收购完成后，母子公司之间如果发生商品购销、服务提供、资产租赁、资金借贷等关联交易，必须遵循以下税务规则：
- 独立交易原则：关联方之间的交易价格应当符合独立企业之间公平交易的原则，不得通过人为定价转移利润或规避税负。税务机关有权对不符合独立交易原则的关联交易进行纳税调整。
- 发票开具：母公司向子公司销售货物或提供服务时，母公司应按自身纳税人身份开具发票——若母公司为小规模纳税人，只能开具增值税普通发票或由税务机关代开增值税专用发票（征收率3%）；子公司收到发票后，按一般纳税人的抵扣规则进行进项处理。
- 关联申报：在年度企业所得税汇算清缴时，存在关联交易的企业需填报《企业年度关联业务往来报告表》，如实披露关联交易的类型、金额及定价方法。
五、收购后的集团税务管理建议
- 统一税务管理口径：虽然母子公司各自纳税，但建议集团层面建立统一的税务管理制度，特别是对关联交易的定价政策、发票管理流程、申报时间节点等进行规范。
- 关注母公司销售额变化：如果母公司因收购后业务扩张导致自身年销售额接近或超过500万元标准，需提前规划是否主动申请转为一般纳税人，避免被动超标后无法及时调整业务模式。
- 子公司进项发票管理：子公司作为一般纳税人，应继续加强进项发票的取得与管理，确保合规抵扣，降低集团整体税负。
- 定期进行集团税务健康检查：建议每半年对母子公司各自的纳税申报、发票使用、关联交易等事项进行内部复核，及早发现潜在风险。
六、特殊情形提示
如果母公司计划在收购后将子公司吸收合并（即子公司注销法人资格，资产、负债、人员并入母公司），则母公司的纳税人身份将发生实质性变化——母公司因合并取得的存货、设备等资产在后续销售或使用中涉及的增值税处理，须结合资产重组相关税收政策进行判断，可能涉及进项税额的转移或重新确认。