一、先区分“零申报”和“不做账”是两件事
第三季度开票金额为0，只是说明没有开具发票，不等于没有业务、没有成本、不需要做账。取得发票有金额，说明企业发生了采购、费用或其他支出，会计上必须入账。即使没有收入，也要把进项发票、付款记录、费用单据登记入账，否则账实不符，后续汇算清缴、税务核查都会出现问题。零申报是申报表的一种填写结果，不是不做账的理由。
二、增值税申报：可以零申报，但要确认没有未开票收入
小规模纳税人第三季度没有开票，如果也没有未开票收入，增值税申报表销售额填0，应纳税额填0，可以零申报。取得进项发票不影响增值税零申报，因为小规模纳税人不能抵扣进项，进项发票只是成本费用凭证。但要注意：如果第三季度有未开票收入，比如现金销售、平台收款、微信支付宝收款，即使没开发票，也要确认收入并申报，不能因为开票金额为0就零申报。金税系统会比对银行流水、平台数据和申报收入，长期有进项无收入容易触发预警。
三、企业所得税申报：不能简单零申报
企业所得税看的是利润，不是开票金额。第三季度没有收入，但如果有成本、费用、工资、房租、水电等支出，利润就是负数，应申报亏损，而不是零申报。零申报和亏损申报是两回事。零申报意味着收入、成本、利润全部填0；亏损申报意味着收入填0或实际数，成本费用按账面数填列，利润为负数。如果企业确实没有任何收入，也没有任何成本费用，才可以零申报。但只要取得了发票，就说明有成本费用发生，应当按实际账面数申报。
四、账务处理必须做
即使没有收入，第三季度也要做账。取得进项发票时，根据用途入账。例如采购库存商品：借库存商品，贷银行存款或应付账款；发生办公费：借管理费用—办公费，贷银行存款；支付房租：借管理费用—房租或预付账款，贷银行存款。小规模纳税人进项不能抵扣，按价税合计入成本费用。期末结转损益，形成亏损。账做完后，企业所得税申报表才能与账面一致。
五、连续追问的概括处理
原追问“没做账，那企业所得税是不是也是零申报”，这里要纠正：没做账不等于可以零申报。正确做法是先把第三季度的账补做，确认收入、成本、费用和利润，再按账面数申报增值税和企业所得税。增值税可能零申报，企业所得税通常按实际亏损申报，不能图省事直接全零。
六、长期零申报的风险
长期零申报但持续有进项发票、银行流水、社保工资、房租支出，税务系统会识别为异常。可能被要求说明为什么有成本无收入、是否存在隐匿收入、是否走逃失联。如果被认定为有收入未申报，需要补增值税、企业所得税、滞纳金，甚至罚款。因此，有进项无收入时，更要规范做账、如实申报亏损，保留合同、发票、付款记录、费用凭证。
七、操作建议
第一步，把第三季度所有进项发票、费用单据、银行回单收集齐全。第二步，按业务性质做账，确认成本费用。第三步，核对是否有未开票收入。第四步，增值税按实际销售额申报，无收入可零申报；企业所得税按利润表申报，亏损就填亏损。第五步，保留申报表、财务报表、发票和凭证，备查。这样既符合申报要求，也避免长期零申报带来的风险。