一、先分清两个税种，不能混在一起判断
个体工商户查账征收下，增值税和经营所得个人所得税是两套独立的计税逻辑。增值税看销售额，经营所得个税看利润。第三季度收入38万元，是否缴增值税，取决于纳税人身份、开票类型和免税额度；是否缴经营所得个税，取决于全年收入减成本费用后的应纳税所得额。交了增值税，不代表就不用交经营所得个税；反过来，经营所得亏损，也可能仍然要交增值税。两者要分别计算，不能因为交了其中一个就忽略另一个。
二、增值税：超过季度免税额度就要全额计算
小规模纳税人个体工商户，通常按季度申报增值税。现行政策下，季度销售额未超过30万元，开具普通发票的，免征增值税；超过30万元的，就全部销售额计算缴纳增值税，而不是只就超过部分计算。第三季度收入38万元，已超过30万元免税额度。若全部开具普通发票，应按1%征收率计算，不含税销售额等于38万除以1.01，约为37.62万元；应缴增值税约为37.62万乘以1%，等于3762元。若其中部分开具增值税专用发票，专票部分不能享受免税，按开票税额计算。若个体工商户属于一般纳税人，则按适用税率计算销项税额，并可抵扣进项。附加税费以实际缴纳增值税为基数，城建税、教育费附加、地方教育附加合计通常为增值税的12%左右，小规模纳税人可享受减半优惠。
三、经营所得个税：按利润计算，不是按收入直接乘税率
查账征收下，经营所得个人所得税的计税依据是应纳税所得额，等于全年收入总额减成本、费用、损失，再减基本减除费用。基本减除费用为每年6万元，这里按8万元说明。假设第三季度收入38万元，全年预计收入152万元；猪肉或商品成本按80%估算，全年成本约121.6万元；房租、水电、人工等费用全年约15万元。则应纳税所得额等于152万减121.6万减15万减8万，等于7.4万元。经营所得适用五级超额累进税率：不超过3万元部分按5%，超过3万元至9万元部分按10%。7.4万元中，3万元按5%等于1500元，剩余4.4万元按10%等于4400元，合计5900元。2027年底前，个体工商户经营所得可享受减半征收，实际约2950元。若成本票严重不足，利润会虚高，个税也会大幅增加。
四、查账征收与核定征收的区别
查账征收看利润，有成本票才能扣除，亏损不缴个税。核定征收看收入，按行业所得率计算，不管实际盈亏。以零售行业为例，若核定所得率为5%，全年收入152万元，应纳税所得额为152万乘以5%等于7.6万元，再按税率表计算，结果与查账不同。两种方式不能混用，具体由主管税务机关认定。查账征收下，成本发票、费用凭证、工资表、房租合同、银行回单都要保存齐全，否则汇算清缴时无法扣除。
五、连续追问概括
原追问“这38万全交增值税，是不是还要交经营所得税”，答案是：增值税看是否超过季度30万元免税额度，超过就全额计算；经营所得个税看全年利润，和增值税是两回事。即使增值税按1%交了，经营所得个税仍要按利润申报。若成本票不足，应纳税所得额会偏高，个税税负明显上升。建议先核对成本费用凭证，再测算全年利润，最后分别申报增值税和经营所得个税。