一、项目总利润：不含税收入减成本，再扣附加税。
客户支付含税135.6万元，对应不含税收入120万元、销项税15.6万元。B公司采购成本36万元为普票，不能抵扣进项，全额计入成本。项目毛利为120减36等于84万元。增值税总负担为销项15.6万元减退项0，等于15.6万元，由A、B两公司分别承担。附加税按增值税的12%计算（城建税7%、教育费附加3%、地方教育附加2%），为15.6乘12%等于1.872万元。项目税前利润为84减1.872等于82.128万元。这是整个项目在扣除附加税后、所得税前的利润，也是“利润平分”应当使用的基数。
二、当前开票金额下，双方实际利润并未平分。
A公司：不含税收入120万元，不含税成本60万元（B公司开票67.8万元，其中不含税60万元），销项15.6万元，进项7.8万元，增值税净负担7.8万元，附加税0.936万元，税前利润为120减60减0.936等于59.064万元。B公司：不含税收入60万元，成本36万元，销项7.8万元，无进项，增值税净负担7.8万元，附加税0.936万元，税前利润为60减36减0.936等于23.064万元。两者相加82.128万元，与项目总利润吻合，但A公司59.064万元、B公司23.064万元，差距36万元，远未达到平分。
三、要实现税前利润平分，B公司开票金额需要上调。
设B公司不含税收入为Y，则A公司税前利润为120减Y减(15.6减Y乘0.13)乘0.12，B公司税前利润为Y减36减Y乘0.13乘0.12。令两者相等，解得Y约等于78.3万元，含税开票金额约为78.3乘1.13等于88.48万元。此时A、B税前利润各约41.06万元。也就是说，在当前67.8万元的开票金额下，B公司少开了约20.68万元（含税），利润分配自然偏向A公司。增值税总负担15.6万元不变，但A公司净负担降至约5.42万元，B公司净负担升至约10.18万元——B公司开票越多，承担的增值税越多，但收入也越高，利润反而上升。用户担心的“我们开票多、增值税承担多”是事实，但增值税负担增加的同时利润也在增加，两者不能混为一谈。
四、如果约定的是税后净利润平分，还要再扣所得税。
假设双方均适用25%税率、无其他调整，按调整后Y等于78.3万元计算，A、B税前利润各41.06万元，所得税各10.265万元，税后净利润各30.795万元。若维持当前67.8万元开票，A公司税后44.298万元、B公司17.298万元，B公司少分约13.5万元。因此，协议中必须明确“平分”是税前还是税后，否则执行时各说各话。
五、账务与结算要点。
B公司按调整后的含税金额向A公司开票，A公司据此确认成本、取得进项；A公司向客户开票120加15.6万元，进项与销项的差额即其净增值税负担。双方各自申报附加税和所得税，不互相代扣。概括来说：项目税前总利润82.128万元，当前开票下A公司59.064万元、B公司23.064万元，并未平分；要实现税前平分，B公司含税开票应约88.48万元而非67.8万元；增值税总负担不变但双方分担随之变化；协议须明确平分基数是税前还是税后，否则结算必然产生争议。