第一，账务处理：科目统一，但计提期间必须归属受益年度。 年终奖在性质上是工资薪金的一部分，计提时按受益对象计入相应成本费用，借记“管理费用”“销售费用”“生产成本”等科目，贷记“应付职工薪酬——工资”。如果企业已经设置了“奖金”或“绩效”等更细的明细，作为工资的子级使用并无不可，但不应把“年终奖”与“工资”做成两个平行的一级明细，更不应在发放时另起一套科目。比科目选择更重要的是计提时点：年终奖如果是对上一年度业绩的兑现，费用原则上应在服务提供的期间确认，而不是等到实际发放的月份才一次性计入当期。金额确定较晚的，可以先合理暂估计提，实际发放时调整差额，避免跨年费用集中堆积在发放当月，影响利润的可比性。
第二，合并发放：一笔转账可以，但账务和申报的“合”与“分”要分清。 年终奖与当月工资在同一月份发放，甚至通过一笔银行转账合并支付，在资金操作上完全可行，备注写“工资及奖金”或分别列明即可，不必刻意拆成两笔回单。账务处理上可以合并：计提和发放的分录与当月工资一并制作，代扣的个人所得税也统一计入“应交税费——应交个人所得税”，不因资金来源是工资还是奖金而改变科目归属。但个税申报上是否合并，取决于计税方式的选择，不由转账形式决定。选择单独计税的，年终奖部分填入“全年一次性奖金收入”栏次，以奖金收入除以12个月得到的数额查找月度税率表，单独计算税款，不与当月工资的累计预扣合并；选择并入综合所得的，才与当月工资合并，按累计预扣法计算。单独计税在一个纳税年度内对同一纳税人只能使用一次，同一笔奖金不能拆分处理。因此，账上做在一起、回单打成一笔，都不影响申报表上按上述规则分别填报。
第三，税款所属期跟随实际发放月份，不跟随奖金名义归属年度。 年终奖在几月发放，就属于几月的收入，在发放次月的申报期内完成扣缴申报。上一年度的年终奖在本年一月发放，税款所属年度就是本年，不能追溯进上一年度的申报表。这也意味着，会计上按受益年度计提、税务上按发放月份申报，两者存在时间差是正常的，不需要用科目调整去“强行对齐”。
第四，残保金的工资总额包含年终奖，口径是“应发”而非“实发”。 残保金计算中的“上年在职职工工资总额”，按照国家统计局关于工资总额组成的规定执行，包括计时工资、计件工资、奖金（含全年一次性奖金） 、津贴补贴、加班工资等全部货币性收入。因此，年终奖必须计入残保金的计提基数，不能因为个税上选择了单独计税就从工资总额中剔除。填报时使用应发口径，即扣除个人所得税和个人承担社保公积金之前的金额，与实发到账金额无关。
小结：科目统一走“应付职工薪酬——工资”，计提归属受益年度；合并发放不妨碍账务合并，个税按单独或并入的选择在申报表上分别填报；残保金工资总额含年终奖，按应发口径计算。需要区分的是申报表，不是会计科目。